Vyriausybės nuomone jau dabartinė gyventojų pajamų apmokestinimo sistema dėl taikomo neapmokestinamojo pajamų dydžio (NPD) jau yra progresinė, todėl netikslinga daryti pakeitus, be to būtų slepiamas darbo užmokestis bei kvalifikuotų darbuotojų „nutekėjimas” į kitas valstybes.
Taikant nuo 2009 m. sausio 1 d. įsigaliojusį neapmokestinamojo pajamų dydžio skaičiavimo principą, gyventojai, gaunantys 800 litų per mėn., realiai apmokestinami 6,2 proc. gyventojų pajamų mokesčio tarifu, o 4000 litų per mėn. – 15 proc. Įvedus progresinius GPM tarifus, siekiant išvengti dvigubo progresiškumo, tektų atsisakyti regresinio NPD taikymo, visiems gyventojams nustatant vienodą 470 litų NPD. Tokiu būdu nacionalinio biudžeto pajamos 2010 m. sumažėtų dar apie 420 mln. litų.
Vyriausybės atmestame įstatymo pakeitimų projekte buvo siūloma, kad gyventojo metinėms pajamoms esant iki 48000 litų imtinai taikyti 14 proc. mokesčio tarifą, metinėms pajamoms nuo 48000 iki 84000 litų – 19 proc. tarifą ir metinėms pajamoms virš 84000 litų – 24 proc. tarifą, 2010 m. nacionalinis biudžetas netektų apie 220 mln. litų pajamų.
Iš viso nacionalinis biudžetas 2010 m. netektų apie 640 mln. litų, o valdžios sektoriaus deficitas dėl to padidėtų 0,7 procentinio punkto.