Pastaruosius du sezonus M. Šernius užėmė trenerio asistento pareigas Ukrainos komandoje Slobožanskės „Prometey“. Praėjusiame sezone klubas gan sėkmingai startavo Europos taurėje ir grupių etapą užbaigė 4-oje pozicijoje, o iš turnyro pasitraukė ketvirtfinalyje.
2020-2021 m. sezone, užimdamas Prienų „CBet“ vyriausiojo trenerio pareigas šilutiškis buvo išrinktas Lietuvos krepšinio lygos metų treneriu.