Prie lygos prisijungė Plungės „Olimpas“, Alytaus „Dzūkija“, Šakių „Zanavykas“ ir Birštono „Jazz-Diremta“.
Sportiniu principu į NKL patekęs RKL čempionas „Olimpas“ užims iš lygos iškritusio Šiaulių „ABRO–Universiteto“ vietą. Po susispendavimo grįžusi Kauno „Erelita“ keliasi į Alytaus areną ir žais „Dzūkijos“ pavadinimu. Praėjusių metų NKL čempionų Kauno „LKKA–Atleto“ komanda keliasi į Birštoną ir vadinsis Birštono „Jazz–Diremta“. „Zanavykas“ į NKL pateko komerciniu keliu.
2012-2013 metų NKL sezone rungtyniaus šios komandos:
Birštono „Jazz–Diremta“
Vilniaus „Statyba“
Kauno „Žalgiris–Sabonio krepšinio centras“
Klaipėdos „Nafta-Universitetas“
Vilniaus „Š. Marčiulionio K.A.-Twomenas“
Marijampolės „Sūduva-Mantinga“
Jonavos „Triobet“
Radviliškio „Radviliškis-Juodeliai“
Joniškio „Delikatesas“
Mažeikių „Mažeikiai“
Molėtų „Ežerūnas-Karys“
Pakruojo „Meresta“
Vilniaus „Perlas-MRU“
Šilutės „Šilutė“
Gargždų „Gargždai–Bremena“
Alytaus „Dzūkija“
Plungės „Olimpas“
Šakių „Zanavykas“