Dar nesibaigus 2012-2013 metų sezonui tapo aišku, jog iš NKL sportiniu principu iškrito paskutinę vietą reguliariame sezone užėmusi Gargždų „Garždai-Bremena“. Balandžio mėnesį NKL finalo ketverte triumfavę „Mažeikiai“ beldėsi į LKL, tačiau aukščiausios Lietuvos krepšinio lygos durys NKL čempionams neprasivėrė. Kartu su dar 16 klubų mažeikiškiai birželio mėnesį pateikė išankstines paraiškas dalyvauti 2013-2014 metų NKL čempionate. Tuomet savo noru nepateikusi paraiškos su NKL čempionatu atsisveikino Pakruojo „Meresta“.
Artėjant 2013-2014 metų sezono pradžiai, paraišką dalyvauti NKL pirmenybėse atsiėmė „Šarūno Marčiulionio krepšinio akademijos“ klubas, o paskutiniu momentu dėl finansinių sunkumų iš čempionato pasitraukė Vilniaus „Statyba“.
2013-2014 metų sezone NKL čempionate varžysis: Vilniaus „Vilnius-MRU“ (buvęs Vilniaus „Perlas-MRU“), Kauno „Žalgiris-2“, Kauno „JAZZ-KTU“ (buvusi Birštono „Jazz-Diremta“), Klaipėdos „Nafta-Universitetas“, Marijampolės „Sūduva-Mantinga“, Mažeikių „Mažeikiai“, Jonavos „Triobet“, Radviliškio „Radviliškis-Juodeliai“, Joniškio „Delikatesas“, Molėtų „TiuMenas-Ežerūnas“ (buvęs Molėtų „Ežerūnas-Karys“), Šilutės „Šilutė“, Palangos „Palanga“, Plungės „Olimpas“, Šakių „Zanavykas“ ir Trakų „Trakai“.
Čempionato formatas nekinta
Nepaisant sumažėjusio komandų skaičiaus, reguliarus sezonas vyks dviejų ratų sistema. Komandos tarpusavyje sužais po dvejas rungtynes (vienerios namų arenoje, kitos – išvykoje), iš viso reguliariame sezone įvyks 210 rungtynių.
Atkrintamose varžybose – aštuntfinalyje ir ketvirtfinalyje - komandos rungsis iki trijų pergalių. Paskutinę vietą reguliariame sezone užėmusi komanda iškris į RKL. Balandžio mėnesį NKL sezoną vainikuos finalo ketverto turnyras.
Sezono pradžia – spalio 3 dieną
Kaip ir praėjusiame sezone, 2013-2014 metais NKL rungtynės bus žaidžiamos penktadieniais ir šeštadieniais. Pirmi du turai vyks spalio 4-5 dienomis. Tiesa, sezono atidarymo mačas vyks diena anksčiau – spalio 3-ią dieną. Sezoną „atidarys“ Molėtų „TiuMeno-Ežerūno“ ir Plungės „Olimpo“ dvikova.
Pirmų dviejų NKL turų tvarkaraštis:
Pirmas turas
Spalio 3 diena, ketvirtadienis, 18:00 val.
Molėtų „TiuMenas-Ežerūnas“ – Plungės „Olimpas“
Spalio 4 diena, penktadienis, 18:00 val.
Trakų „Trakai“ – Mažeikių „Mažeikiai“
Klaipėdos „Nafta-Universitetas“ – Palangos „Palanga“
Radviliškio „Radviliškis-Juodeliai“ – Jonavos „Triobet“
Joniškio „Delikatesas“ – Marijampolės „Sūduva-Mantinga“
Kauno „JAZZ-KTU“ – Šakių „Zanavykas“
Šilutės „Šilutės“ – Vilniaus „Vilnius-MRU“
Antras turas
Spalio 5 diena, šeštadienis, 16:00 val.
Mažeikių „Mažeikiai“ – Šilutės „Šilutė“
Vilniaus „Vilnius-MRU“ – Molėtų „TiuMenas-Ežerūnas“
Plungės „Olimpas“ – Kauno „JAZZ-KTU“
Šakių „Zanavykas“ – Joniškio „Delikatesas“
Marijampolės „Sūduva-Mantinga“ – Radviliškio „Radviliškis-Juodeliai“
Kauno „Žalgiris-2“ – Klaipėdos „Nafta-Universitetas“
Palangos „Palanga“ – Trakų „Trakai“