Raseinių Marcelijaus Martinaičio viešosios bibliotekos Butkiškės filialo vyresnioji bibliotekininkė Vilma Augustinavičienė teigia, kad ši medinė bažnytėlė parapijiečiams labai reikšminga, tad jie viliasi, jog su pačiu pastatu atgims ne tik parapija, bet ir sugrįš senosios tradicijos: pavyzdžiui, koncertai, krikšto, santuokos sakramentai.
Miestelio istorija besidominti V. Augustinavičienė pasakoja rašytiniuose šaltiniuose aptikusi bažnyčios sąsajas su Vydūnu, o labiausiai parapijiečiams imponuoja tai, kad 1962–1966 metais čia dirbo kunigas Algirdas Mykolas Dobrovolskis – Tėvas Stanislovas. Varpinėje išlikę keletas jo liktorių.
Nors iš pradžių ketinta atlikti valstybės saugomos bažnyčios ne tik išorės, bet ir vidaus tvarkybos darbus, tačiau šiuos planus pakoregavo polichrominių tyrimų metu atrastas XX a. pradžios dekoras. Lietuvos restauratorių asociacijos vadovo Aidono Valkiūno teigimu, bažnyčiose toks dekoras išties retas: „Jis yra tautinių motyvų art deco stiliaus, o tokie raštai dažniausiai būdingi audiniams. Stebina tai, kad dekoruotos praktiškai visos bažnyčios sienos. Iš kelių atidengtų zondų galime surinkti vientisą kompoziciją. Į tyrimo medžiagą esame įdėję šį retrospekcinį vaizdą. Norint dekorą restauruoti, konservuoti arba atkurti, reikėtų parengti restauravimo programą, kuri būtų tarsi gidas tolesniems darbams.“
A. Valkiūną nustebino ne tik dekoras, bet ir viename altorių esantis Mergelės Marijos paveikslas. Šalia jo kabantys votai taip pat liudija ypatingą kūrinio reikšmę.
„Vienas iš votų mus nustebino labiausiai – prancūzų Garbės legiono ordino medalis. Jis paprastai suteikiamas karininkams. Votas kabinamas tada, kai stebuklas išsipildo ir kai patvirtinama stebuklo galia. Greičiausiai karininkas šį apdovanojimą buvo gavęs už pergales kituose mūšiuose. Gali būti, kad vienas iš tų karininkų taip pat meldėsi šioje bažnyčioje ir paaukojo savo apdovanojimą veikiausiai dėkodamas už išsaugotą gyvybę. Dėl to lengva datuoti šį artefaktą – aišku, kad tai yra 1812 metai. Paveikslas, tikėtina, senesnis. Jo dar laukia tyrimai“, – reziumuoja Lietuvos restauratorių asociacijos vadovas.
Tvarkybos darbus Butkiškės Šv. Jono Krikštytojo bažnyčioje organizavo Kultūros infrastruktūros centras.