Savo penkerių metų LMTA vizijos ir veiklos gairėse J. Žukienė akcentavo bendruomenės telkimo svarbą, siekį įtvirtinti LMTA kaip patrauklios tarptautinės aukštosios menų mokyklos ir regioninės lyderės reikšmę, studijų kokybės stiprinimą, bendradarbiavimo su socialiniais partneriais intensyvinimą.
LMTA rektoriaus konkurse taip pat dalyvavo džiazo pianistas profesorius Artūras Anusauskas. Judita Žukienė pakeis dvi kadencijas LMTA vadovavusį pianistą profesorių Zbignevą Ibelgauptą.
Judita Žukienė 1997 m. baigė Lietuvos muzikos akademiją. 2001 m. apgynė daktaro disertaciją „Nespecifinės muzikos prasmės“. Nuo 2001 m. – Muzikos istorijos katedros dėstytoja, nuo 2006 m. – docentė. 2005–2011 m. buvo Muzikos istorijos katedros vedėja, 2011 m. tapo LMTA mokslo prorektore. Taip pat 1998–2003 m. su pertraukomis dirbo Mokslo ir enciklopedijų leidybos instituto moksline redaktore.
J. Žukienė taip pat dėstė ir stažavo Latvijos J. Vytuolo muzikos akademijoje, Belgrado menų universitete, Karališkoje Danijos muzikos akademijoje, Norvegijos muzikos akademijoje Osle, Romos Santa Cecilia muzikos konservatorijoje, Orfėjaus institute Gente, Karališkoje Antverpeno konservatorijoje.
Mokslinių interesų kryptys – Lietuvos muzikos istorija, muzikos estetika, meninių tyrimų metodologija, muzikos edukologija. J. Žukienė yra paskelbusi mokslo straipsnių, knygų skyrių, mokslo populiarinimo publikacijų, vykdžiusi mokslo projektus, dalyvavusi įvairių darbo grupių ir komisijų darbe.