Ikiteisminis tyrimas dėl pirmojo nužudymo buvo pradėtas 2013 metų balandžio 6 dieną, kai Linkuvos gimnazijoje buvo rastas nužudytas sargas. Tą naktį mokykloje budėjusio vyro kūną jo kabinete kitą rytą rado žmona ir sūnus.
Per dvejus metus trukusias nusikaltėlio paieškas buvo ne vienas įtariamasis, tačiau įrodymų, grindžiančių įtariamųjų kaltę, neužtekdavo, praneša Šiaulių apskrities policija.
Ikiteisminis tyrimas pasisuko kita kryptimi, kai po dvejų metų, balandžio mėnesį tame pačiame miestelyje dingo 21 metų mergina. Mergina, pasak jos sugyventinio Š. Žemaičio, išėjo iš namų 2015 metų balandžio 11-osios ryte ir negrįžo.
Po savaitę trukusių paieškų dingusioji Samanta Rakauskaitė buvo rasta negyva šulinyje, netoli Linkuvos esančiame Mūravoto kaime.
Iki tos akimirkos, kol vyko paieška, Š. Žemaitis vaidino pasimetusį ir liūdintį sugyventinį. Kai ikiteisminį tyrimą atlikę Šiaulių apskrities vyriausiojo policijos komisariato Kriminalinės policijos Sunkių nusikaltimų tyrimo valdybos pareigūnai rado merginos kūną, sugyventinis prisipažino, kad jis yra susijęs su S. Rakauskaitės mirtimi.
Iš karto sulaikytas, o vėliau trims mėnesiams suimtas, Š. Žemaitis prisipažino nužudęs savo sugyventinę. Bylos duomenimis, tą vakarą jie susipyko ir kaltinamasis trenkė savo vaiko motinai. Bijodamas, kad ji gali iškviesti policiją dėl panaudoto smurto, vėliau ją uždusino. Norėdamas paslėpti kūną, išvežė jį užsidėjęs ant motorolerio ir paslėpė šulinyje, kur vėliau kūnas ir buvo rastas.
Vykdant ikiteisminį tyrimą dėl S. Rakauskaitės nužudymo buvo apklausiami liudytojai ir vienas iš jų, jau po Š. Žemaičio sulaikymo, nurodė, kad žinojo apie Š. Žemaičio anksčiau įvykdytą žmogžudystę gimnazijoje. Tą 2013 metų balandžio 5-osios naktį, būdamas apsvaigęs nuo alkoholio, Š. Žemaitis, kaip įtariama, ėjo vogti tuo metu renovuojamojoje gimnazijoje esančių statybinių medžiagų ir išsigandęs, kad pamatęs jį mokyklos viduje sargas iškvies policiją, pargriovė jį ant žemės ir kelis kartus trenkė.
Š. Žemaitis iš dalies pripažįsta savo kaltę dėl sargo nužudymo ir visiškai sutinka su jam reiškiamais kaltinimais dėl sugyventinės nužudymo.
Dviguba žmogžudyste kaltinamam Š. Žemaičiui pagal Baudžiamojo kodekso 129 straipsnio 2 dalies 6 ir 9 punktus bei 180 straipsnio 2 dalį gresia laisvės atėmimas iki gyvos galvos.