"Kaip Vakarų musulmonai, mes priimame naujojo popiežiaus vardą kaip viltį teikiantį priminimą. Pranciškus Asyžietis davė pasauliui puikų šventumo ir atvirumo Rytams ir islamui pavyzdį", - teigia Italijos Islamo religinė bendruomenė.
Vatikano santykiai su musulmonų pasauliu buvo smarkiai įtempti 2006 metais, kai dabar jau buvęs popiežius Benediktas XVI citavo Bizantijos imperatorius, sakydamas, kad islamas buvo smurto ir iracionalumo tikėjimas. Tokie žodžiai sukėlė smurto protestus musulmonų pasaulyje. Benediktas XVI atsiprašė, tačiau daugelis musulmonų taip ir liko nepatiklūs Vokietijoje gimusio popiežiaus atžvilgiu.
Naująjį popiežių taip pat sveikino Saudo Arabijos Islamo bendradarbiavimo organizacija (OIC). Jos sveikinime tikimasi, kad "santykiai tarp islamo ir krikščionybės atgaus savo nuoširdumą ir draugystę".