Полиция использовала слезоточивый газ для разгона демонстрантов, которым удалось преодолеть заграждения из колючей проволоки вокруг дворца.
Десятки тысяч демонстрантов протестуют против поспешного, по их мнению, решения о проведении референдума по новой конституции, а также против расширения полномочий президента Мурси.
Президент в течение дня находился во дворце, но покинул его после того, как протесты расширились.
Многие из собравшихся в районе Гелиополис, где расположен дворец, скандировали лозунги, подобные тем, которые выкрикивались толпами во время восстания против режима Мубарака в феврале 2011 года.
Белые страницы
У стен дворца остаются тысячи людей. На площади Тахрир в центре Каира также продолжается митинг протеста.
В заявлении, зачитанном по телевидению, египетские силы безопасности призвали участников демонстраций к сдержанности.
Во втором по величине городе страны, Александрии, также собралась толпа демонстрантов.
Президент Мурси принял 22 ноября декрет, в котором наделил себя новыми полномочиями и лишил органы правосудия каких-либо возможностей оспаривать его решения.
Он также назначил на 15 декабря референдум по вопросу о новой конституции, которая, как считают противники президента, была принята поспешно и не защищает права меньшинств, в особенности женщин.
Мохаммед Мурси, который незначительным большинством голосов победил на июньских президентских выборах, заявил, что откажется от новых полномочий после принятия конституции.
Однако его действия вызвали в стране широкие протесты.
Во вторник несколько каирских газет не вышли или же вышли с пустыми первыми страницами в знак протеста против отсутствия гарантий свободы печати в новой конституции.