На странице «Проекта» в Instagram в настоящее время опубликовано сообщение о том, что «эта страница недоступна». Блокировка мотивировалась неким «нарушением норм сообщества», уточнил Баданин. «В чем заключалось нарушение, кто пожаловался и на что, Instagram ответа не дает», — написал он.
Издание «Проект» и его юридическое лицо Project Media, Inc. («Проект Медиа») были признаны «нежелательной организацией» 15 июля.
Журналисты издания, в том числе Баданин, а также Ольга Чуракова, Юлия Лукьянова, Петр Маняхин и Мария Железнова были внесены в список СМИ-«иностранных агентов». Также в список «иностранных агентов» попали главный редактор «Открытых медиа» Юлия Ярош и ее заместитель Максим Гликин, а также журналист «Радио Свобода» (власти РФ внесли эту организацию в реестр иностранных СМИ, выполняющих функции иностранного агента) Елизавета Маетная.
29 июня сообщалось, что у Баданина, а также у журналистов «Проекта» Марии Жолобовой и Михаила Рубина прошли обыски. Обыски проводились по уголовному делу о клевете, которое было возбуждено в 2017 году после выхода расследования «Дождя», главредом которого ранее был Баданин, о бизнесмене Илье Трабере.
Однако сам журналист выражал уверенность, что дело Трабера стало предлогом для репрессий в отношении редакции «Проекта». В день их проведения издание опубликовало расследование о собственности семьи главы МВД Владимира Колокольцева.