Šių šalių klubai palankius sau rezultatus užsitikrino antrose rungtynėse išvykose.
Antrame etape žaisti teisę iškovojo: „Hibernians“ (Malta), „Vikingur“ (Farerai), TNS (Velsas), „Alaškert“ (Armėnija) ir „Linfield“ (Š. Airija).
Nuo antro etapo kovas Čempionų lygos turnyro atrankoje pradės ir Lietuvos čempionas Vilniaus „Žalgiris“. Vilniečių pirmas varžovas Razgrado klubas „Liudogorec“ (Bulgarija). Žalgiriečiai pirmas rungtynes liepos 12-ą dieną žais Vilniuje, o atsakomas mačas vyks liepos 19-ą dieną Bulgarijoje.
Rezultatai:
Talino „Infonet Tallinn“ (Estija) 0 - 1 „Hibernians“ (Malta)*** (pirmas mačas – 0:2, bendras – 0:3);
„Trepca 89“ (Kosovas) 1 - 4 „Vikingur“ (Farerai)*** (1:2, 2:6);
„Europa“ (Gib) 1 - 3 TNS (Velsas)***, – po pratęsimo (1:2). (2:1, 3:4);
„Santa Coloma“ (Andora) 1 - 1 „Alaškert“ (Armėnija)*** (0:1, 1:2);
„La Fiorita“ (San Marinas) 0 - 0 „Linfield“ (Š. Airija)*** (0:1, 0:1).
*** – pateko į kitą etapą