1962 metais patvirtintas saugotinų augalų sąrašas, o 1976 metais Ministrų Taryba patvirtino Lietuvos Raudonosios knygos sąrašus. 1981 metais išleista pirmoji Lietuvos Raudonoji knyga, kurioje buvo 41 paukščių rūšis, visa kamanių gentis ir 30 induočių augalų rūšių.
Antroji knyga pasirodė 1992 metais, o joje buvo jau 501 saugotina rūšis. Nuo to laiko iki 2003 metų šį sąrašą papildė 314 rūšių. Iš viso sąraše - daugiau kaip 800 saugomų (259 gyvūnų, 357 augalų, 134 grybų, 65 kerpių) rūšių.
Remdamasi šiais duomenimis, 2007 metais Aplinkos ministerija išleido trečiąją Lietuvos Raudonąją knygą. Numatyta, kad toks dokumentas turi būti leidžiamas ne rečiau kaip kas 10 metų.
mRaudonoji knyga supažindina visuomenę su Lietuvos teritorijoje saugomomis rūšimis, populiacijos tankumu, joms gresiančiu pavojumi, paplitimu ir biologinėmis savybėmis. Tačiau Raudonosios knygos informacija gali skirtis nuo naujausio saugomų gyvūnų, augalų ir grybų sąrašo.