Paprastoji pakalnutė nėra saugoma rūšis - nei ji įrašyta į Lietuvos saugomų gyvūnų, augalų ir grybų rūšių sąrašą, nei saugoma pagal tarptautinius susitarimus. Ji plačiai paplitusi visoje šalyje, auga kone kiekviename miškelyje. Kai kur veši didžiuliai pakalnučių sąžalynai. Dėl gražių žiedų jos auginamos kaip dekoratyviniai augalai. Pakalnutė yra vaistinis, bet nuodingas augalas.
Aplinkos ministerija primena, kad draudžiama rinkti saugomų rūšių laukinius augalus - įrašytus į Lietuvos saugomų gyvūnų, augalų ir grybų rūšių sąrašą, ir jais prekiauti. Draudžiama skinti ir visų rūšių vandens lelijų ir šilagėlių žiedus ir jais prekiauti, išrauti, iškasti su šaknimis ar kitaip naikinti paprastąjį burbulį; miškinę leliją; lieknąją plukę; pavasarinę raktažolę; didžiažiedę rusmenę.
Teisės aktai saugo ir visų rūšių pataisus - jų negalima rauti, skinti ir prekiauti jais, išskyrus, kai pataisų, neįrašytų į Lietuvos saugomų gyvūnų, augalų ir grybų rūšių sąrašą, sporinės varputės renkamos ir naudojamos vaistinei žaliavai.
Už saugomų rūšių augalų rinkimą, naikinimą ar prekybą jais gresia administracinė atsakomybė -nuo 28 iki 289 eurų bauda.